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[백준] 1969번 DNA (Go)

Development/Algorithm

by thisisnew 2022. 12. 26. 00:01

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https://www.acmicpc.net/problem/1969

 

1969번: DNA

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오

www.acmicpc.net

 

문제

DNA란 어떤 유전물질을 구성하는 분자이다. 이 DNA는 서로 다른 4가지의 뉴클레오티드로 이루어져 있다(Adenine, Thymine, Guanine, Cytosine). 우리는 어떤 DNA의 물질을 표현할 때, 이 DNA를 이루는 뉴클레오티드의 첫글자를 따서 표현한다. 만약에 Thymine-Adenine-Adenine-Cytosine-Thymine-Guanine-Cytosine-Cytosine-Guanine-Adenine-Thymine로 이루어진 DNA가 있다고 하면, “TAACTGCCGAT”로 표현할 수 있다. 그리고 Hamming Distance란 길이가 같은 두 DNA가 있을 때, 각 위치의 뉴클오티드 문자가 다른 것의 개수이다. 만약에 “AGCAT"와 ”GGAAT"는 첫 번째 글자와 세 번째 글자가 다르므로 Hamming Distance는 2이다.

우리가 할 일은 다음과 같다. N개의 길이 M인 DNA s1, s2, ..., sn가 주어져 있을 때 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA s를 구하는 것이다. 즉, s와 s1의 Hamming Distance + s와 s2의 Hamming Distance + s와 s3의 Hamming Distance ... 의 합이 최소가 된다는 의미이다.

 

입력

첫 줄에 DNA의 수 N과 문자열의 길이 M이 주어진다. 그리고 둘째 줄부터 N+1번째 줄까지 N개의 DNA가 주어진다. N은 1,000보다 작거나 같은 자연수이고, M은 50보다 작거나 같은 자연수이다.

 

출력

첫째 줄에 Hamming Distance의 합이 가장 작은 DNA 를 출력하고, 둘째 줄에는 그 Hamming Distance의 합을 출력하시오. 그러한 DNA가 여러 개 있을 때에는 사전순으로 가장 앞서는 것을 출력한다.


package main

import (
	"bufio"
	"fmt"
	"os"
	"strings"
)

func main() {
	var n, m int
	var read = bufio.NewReader(os.Stdin)
	fmt.Fscanln(read, &n, &m)

	var dnas = make([]string, n)

	for i := 0; i < n; i++ {
		var dna string
		fmt.Fscanln(read, &dna)
		dnas[i] = dna
	}

	var hammingDistance int
	var result strings.Builder
	var idx int

	for idx < m {

		var a, c, g, t int
		var max = 0
		var maxC string

		for _, dna := range dnas {
			switch dna[idx : idx+1] {
			case "A":
				a++
			case "C":
				c++
			case "G":
				g++
			case "T":
				t++
			}
		}

		if max < a {
			max = a
			maxC = "A"
		}

		if max < c {
			max = c
			maxC = "C"
		}

		if max < g {
			max = g
			maxC = "G"
		}

		if max < t {
			max = t
			maxC = "T"
		}

		result.WriteString(maxC)
		hammingDistance += n - max
		idx++
	}

	fmt.Println(result.String())
	fmt.Println(hammingDistance)
}

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